Насколько знаю практику в научных кругах - если руководитель дипломников увольняется или, не дай Бог, умирает, то этих дипломников передают другому научному руководителю. К дипломникам же отношение становится очень лояльное, на всё смотрят "сквозь пальцы", не мучают совершенно.
Так что - всё будет нормально!;)
Когда защита?